La pêche de la civelle est interdite sur la façade méditerranéenne française. La pêche de l’anguille aux stades jaunes et argentés se pratique surtout dans les lagunes méditerranéennes et en Corse. On trouve encore quelques pêcheurs fluviaux d’anguilles sur le bassin du Rhône, mais leur nombre est très faible compte-tenu des restrictions imposées par l’administration qui refuse de leur attribuer des licences de pêche à l’anguille sur le Rhône, malgré les levées des interdictions de commercialisation de l’anguille qui étaient en vigueur depuis 2007 en raison de la contamination du fleuve par les PCB. Avant les interdictions PCB et le PGA plus d’une 20aine de pêcheurs fluviaux exploitaient l’anguille sur le Rhône aval et les étangs méditerranéens d’eau douce (Vaccarès). Il n’en reste plus que 10 en 2023, dont seulement 4 disposent d’autorisations de pêche des anguilles jaunes et argentées dans les étangs de Vauvert, Petite Camargue.
Les marins pêcheurs exploitent les lagunes côtières qui représentent au total 58 000 hectares et dont les plus importantes sont : Salses-Leucate (5800ha) ; Thau (7500 ha) ; Berre (15500 ha). En Corse, certains étangs sont exploités comme ceux d’Urbino, de Palo ou de Diana. Pour la pêche maritime en lagunes, le nombre de licences comme partout ailleurs diminue fortement. De 570 licences en 2009, il est passé à 319 en 2019; soit un pêcheur professionnel pour 182 hectares de lagune.